Applied Maths desenvolve software de mapeamento ótico de genomas

A Applied Maths, desenvolvedor do programa BioNumerics, iniciou uma parceria com 5 centros liders de pesquisa da Holanda  para desenvolver uma metodologia de caracterização de conteúdo genômico de microrganismos associados à gado, usando tecnologia de mapeamento ótico genômico. Mapeamento ótico genômico é uma tecnologia que gera rapidamente mapas de restrição de genomas completas, ordenadas e de alta resolução a partir de moleculas singelas de DNA. É uma ferramenta de alto valor para compreender a organização do genoma e uma técnica de tipagem bacteriana de alta resolução e portabilidade. Mais informação sobre mapeamento ótico genômico pode ser obtidas, por exemplo, no wikipedia em http://en.wikipedia.org/wiki/Optical_mapping

O foco principal do projeto de colaboração será o desenvolvimento de um teste diagnostico rápido e de alta sensibilidade para vigilância e monitoração de MRSA (Methicellin-Resistant Staphylococcus Aureus) associado com gado. Uma identificação rápida e confiavel de animais infectados e produtos de origem animal fornecerá melhor entendimento da disseminação desta bactéria problemática e evitar a entrada de patógenos na cadeia alimentar.

Applied Maths irá desenvolver um software específico para interpretar e comparar os mapeamentos óticos de grande quantidade de isolados bacterianos e através dos mapas inferir redes evolucionários de genética de populações em gado e respectivo MRSA hospitalar associado.

Os outros parceiros no projeto são:

• PiEXT BV: uma empresa Holandesa de life sciences que possue uma licença exclusiva no uso da Tecnologia de Mapeamento Ótico  para o desenvolvimento de testes diagnosticos para patógenos,
• National Institute for Public Health and Environments (RIVM): um centro de renome com expertise nos campos de saúde, nutrição e proteção ambiental,
• VU University Medical Center: um laboratório de referência com reconhecimento internacional para estudos epidemiológicos e controle de Staphylococcus aureus, e em particular MRSA,
• Institute for Pig Genetics BV: instituto de suporte para criadores de suínos em seus esforços como fazendas de criação para melhorar estado de saúde dos animais e onde possivel eliminar doenças, e
• VION NV: a maior empresa de produção carne na Europa e a terceira maior em alimentos de consumo humano na Holanda.